就读于CLAMP学院高中部的东国丸健多朗和秋海洞威，是平凡的高中生。但他们还有另一个身份，就是维护学院内和平的正义使者「学园特警杜克莱恩」。为了粉碎邪恶秘密组织「妹之山商店街」想要征服世界的野心，身穿强化战斗服不断战斗，两人的真正身份除了选中它们的长官和学园特警助理?宙尊寺绘里衣外，没有人知道。同样的，也没人发现到宿敌「妹之山商店街」的司令官，竟然就是同班同学的数奇屋桥寿，因此也就继续过著战斗的日子。　　 某天，数奇屋桥竟然对绘里衣一见钟情。在健多朗的困惑和威的惊讶还来不及消失时，没想到绘里衣竟然也对数奇屋桥一见钟情。就在不知对方真实身份的情况下，正以为2人的恋情就要有进展的时候，「妹之山商店街」的女司令官登场了！她宣称数奇屋桥其实是某星球的王子，而自己则是他的未婚妻。女司令官发觉到数奇屋桥和绘里衣是两情相悦的，于是为了抢回心上人，要求跟绘里衣决斗。在战斗中，绘里衣表明了自己是守护地球和平的宇宙警备队所派来的，在知道数奇屋桥的真正身份后，惊讶的无法置信。 但即使成为敌人，也无法改变绘里衣和数奇屋桥深爱对方的心情。於是女司令官将最强的怪兽投入战线，打算和绘里衣进行最后的决战。但是战斗却在数奇屋桥的父亲承认了数奇屋桥和绘里衣的私奔后，轻松落幕。相爱的情侣得到了幸福，而学园也恢复和平。但正义的使者是没有休假的。学园特警今后也会继续为和平而战！