2011年，旧金山警署的Rebecca Madsen侦探（Sarah Jones）奉命调查一宗可怕的谋杀案。她在犯罪现场提取到一枚指纹，经过比对，竟然与阿尔卡特拉斯监狱里曾经关押过的囚犯Jack Sylvane（Jeffrey Pierce客座演出）相符。但那怎么可能？Jack Sylvane早就在几十年前死掉了。Rebecca不禁回忆起自己家的历史：她的祖父和抚养她长大的叔叔Ray Archer（Robert Forster）都在阿尔卡特拉斯监狱里当过狱警。

当Madsen对阿尔卡特拉斯监狱的兴趣越来越浓厚时，神秘、狡诈、无所不知但是什么也不愿意多说的政府特工Emerson Hauser（Sam Neill）突然开始插手干预Madsen的调查工作。尽管如此，性格倔强的Madsen不肯放手。Madsen找到对阿尔卡特拉斯监狱深有研究的漫画迷Diego ＇Doc＇ Soto博士，希望他能帮助自己解开隐藏在一系列神秘事件背后的谜团。