和第十班苦苦和三名音忍周旋，但战况不利。小樱还受了重伤。宁次带领的第三班其他成员赶到，正当他们准备和音忍作战时，佐助的身体适应了咒印，并甦醒过来。愤怒的佐助浑身布满咒印黑色的花纹，向满不在乎承认攻击小樱的萨克发难。由于咒印的力量，佐助占据了绝对优势。他用非常暴力的手法扭断了萨克的手臂，并且准备继续向其他两名音忍复仇。小樱察觉到咒印状态的佐助失去了控制，一把抱住佐助，求他停手。小樱的举动让佐助恢复了正常。在一旁惊恐万状的音忍们留下卷轴，赶紧逃离了现场。

在考试的初试选拔中，佐助的对手是音忍的赤铜铠。在比赛前，卡卡西警告佐助不要使用写轮眼及忍术，否则可能会令咒印爆发（因為查克拉流动会令咒印產生反应），直接被淘汰。战斗开始后，铠使用他的吸收查克拉的忍术大量地吸取佐助的查克拉，占了很大优势。在不能使用写轮眼及忍术的情况下，佐助将他从小李那里复制来的体术稍加变化成为狮子连弹，一招击败了对手。比赛过后，卡卡西封印了佐助身上的咒印以阻止它的发作。大蛇丸突然出现，告诉卡卡西和佐助，如果佐助自己愿意，咒印是无法被封印的。大蛇丸在和卡卡西对峙了一阵后离开了。为了防止佐助经受不起力量的诱惑而使用咒印，卡卡西在接下来的一个月时间里单独陪佐助训练。

佐助在和卡卡西的训练期间，学会了卡卡西的成名绝招千鸟。同时他还针对我爱罗练习了复制来的小李高速的体术。虽然正式比赛的时候迟到，但佐助这一期间的苦练的成果很快显示出来。他的高速移动让我爱罗疲于应付，不得不用沙子将自己全身包围起来。佐助趁此机会首次使用了千鸟，结果穿透了我爱罗的绝对防御，并击伤了后者。

与此同时，砂忍和音忍的木叶崩溃计划开始实施。我爱罗在砂忍的掩护下从木叶村撤退。佐助奉命追击我爱罗，一路上过关斩将，最终追上了后者。佐助一再使出千鸟，并切断了我爱罗用沙所凝成的一只手臂。被激怒的我爱罗使用守鹤的力量反击佐助。而佐助则由于咒印的缘故，体力不支倒下了。紧急关头，鸣人赶到，一番苦战后和击败我爱罗。佐助对于鸣人在这一战中表现出的实力，表现出惊讶和嫉妒。

鼬的复返篇

在得知卡卡西被突然出现在木叶村的鼬击败后，佐助去探望卡卡西打听消息。从卡卡西那里，佐助得知鼬回到木叶村的目的是要寻找鸣人。于是他立刻动身去找鸣人，以向鼬复仇。等找到鸣人的时候，佐助发现鼬已经先到一步。佐助使出绝招千鸟对付鼬，但被鼬随手破解了。虽然佐助不屈不挠，但鼬似乎对他缺乏兴趣，用月读毫不留情地击溃了佐助。鼬嘲笑佐助仍然太弱，因为恨的还不够深。佐助被自来也救起，去木叶村的医院养伤。

佐助营救篇

纲手回到木叶村后，治癒了佐助的伤势。在医院治疗期间，佐助回忆起他在第七班的历程。他发现自己仍然太弱小，无法打败鼬，甚至被从前的吊车尾鸣人超过。心情抑郁的他和前来探望他的鸣人在医院进行了一次对决。虽然这次对决被赶来的卡卡西阻止，但佐助发现鸣人的新忍术（螺旋丸）威力与千鸟差距之大，内心更加不安。卡卡西在事后现身说法劝说佐助不要过于执着对力量的追求，但佐助已经积重难返。这时，大蛇丸派来的音忍四人组吸引了佐助的注意。佐助认识到大蛇丸给予的咒印的力量后，决定跟随音忍离开了木叶村，追随大蛇丸以换取力量。

在佐助离开村子之前，被小樱追上。尽管小樱极力劝说佐助留下，并表白了对佐助的爱意，希望能帮佐助变强。佐助被小樱的话打动了，说了声“谢谢”，然后击昏了小樱，离开了村子。在路上，佐助再次碰到了音忍四人组。这一次音忍给了佐助提升咒印状态的药丸，然后将吃下药丸昏死的佐助封印到特制的棺桶中，带着棺桶离开了。

在音忍一行往大蛇丸方向去的时候，一支由鸣人、鹿丸、牙、宁次和丁次组成的小队在身为中忍的鹿丸的带领下开始了营救佐助的任务。途中，小队的队员分别先后和音忍四人组的成员进行单挑。这期间君麻侣出现，带走了棺桶，但最终被鸣人追上。这时佐助完成了咒印的升级，破桶而出。恰巧小李赶到，拖住了君麻侣。鸣人最终在终结之谷追上了佐助。

佐助在咒印状态下的千鸟佐助与鸣人开始了大战。起先鸣人使用体内九尾的力量占据上风。但佐助在对阵中升级了他的写轮眼，和鸣人打成平手。这时鸣人让九尾的查克拉环绕在自己周围，并长出一条尾巴。而佐助则使用了咒印的状态二，变成了鹰的形态。两人各自使出绝招——鸣人的九尾力量的螺旋丸和佐助的咒印状态的千鸟在终结之谷的大瀑布上碰撞。在僵持状态下，佐助击中了鸣人，而鸣人则在佐助的护额上划出了一条裂纹。两种强力忍术的碰撞产生了巨大的爆炸，爆炸威力足以山崩地裂。之后，鸣人昏倒在地。胜利了的佐助并没有杀死鸣人，因为纵使佐助多渴望得到力量──万花筒写轮眼，他仍绝不希望以杀死自己最重视的同伴鸣人为代价来换取。佐助离开了鸣人，去寻找大蛇丸。

第二部

第二部开始时，佐助的面貌没有太大的变化。他依然冷酷、强大，而且斩断了与鸣人和小樱之间的友谊，全身心地去追求力量。在三人再次见面的时候，佐助毫不犹豫地攻击鸣人和小樱，不留一点情面。但另一方面，对於一些陌生人，他反而不大愿意随意杀戮。佐助和大蛇丸之间也仅仅是互相的利用关系。和其他音忍不同，佐助对大蛇丸既不恐惧也不尊重。只有在训练的时候，他才愿意和大蛇丸在一起。佐助没有佩戴音忍的护额，他身上唯一的标记就是宇智波一族的纹章。

在第一部到第二部的两年半时间裡，佐助的能力大大提高。他使用一把长刀作為武器，并开发了新术千鸟流，可以让全身佈满电流，攻击靠近的敌人。他还掌握了雷系查克拉的状态变化，可以不借助任何媒介使查克拉刀任意变化。可能由於大蛇丸的影响，佐助学会了类似潜隐蛇手的忍术。他对咒印的控制能力也大大提高，可以做到将身体的一部分提升到咒印状态。佐助实力更為深不可测，连九尾都忌三分。

佐助与佐井篇

在第二部中，佐助在和佐井见面时初次登场。他对佐井的出现无动於衷，还对大蛇丸的迟到表示不满。当佐井表示他会与比佐助更加好地和鸣人合作时，佐助用写轮眼震慑了佐井。此后佐井试图帮助鸣人和小樱，将佐助带回木叶村。佐助对眾人的劝说毫不理会，表示只要能杀死鼬，就算